Dijk, K. van (1997) ITS sequenties in populaties van Ascophyllum nodosum (Fucales, Phaeophyta). Master's Thesis / Essay, Biology.
|
Text
Biol_Drs_1997_KvanDijk.CV.pdf - Published Version Download (690kB) | Preview |
Abstract
Ascophyllum nodosum (L) Le Jol is een bruinwier, dat langs de rotskusten van het gematigde deel van de Noord Atlantische Oceaan voorkomt. Ascophyllum is als onderwerp gekozen omdat deze soort een van de studieobjecten is van het EU Programma "Biodiversity and Genetics of Algal Populations" (BIOGAP). Het is een relatiefoude soort en het was onbekend of er in de loop van de tijd genetische verschillen tussen de verschillende populaties zijn ontstaan, zonder dat er morfologische verschillen zijn opgetreden. Onderzocht is, of er genotypische verschillen bestaan tussen de populaties uit Delfzijl, TjarnO, Goteborg, Schotland 'Marien', Scotland 'Estuarien', lerland, Roscoff en Isle of Mann. In het geval dat deze verschillen ci zijn, of er dan sprake is van een andere soort. Hiervoor is gckeken naar de sequenties van de ITS 1 en 2 fragmenten van de verschillende isolaten. Uit de analyse kwamen dne Most Parsimonious Trees, waarin twee groepen te zien zijn. Dc eerste groep bestaat uit isolaten uit Schotland en lerland en de andere groep wordt gevormd door Delfzijl, TjarnO en GOteborg. Roscoffkwam met genoeg overeen met deze groepen en staat alleen. Isle of Mann verschilde relatief veel van de rest, dit is onder andere te wijten aan een insert van 13 base-paren dat in geen enkel ander isola.at voorkomt. Er waren 26 variabele posities waarvan er zeven informatiefwaren, wat erg weimg is. Het grootste verschil was 2,66%, waaruit geconcludeerd kan worden dat de verschillende isolaten wel tot de zelfde soort behoren. Opvallend was een repeat in het ITS 2-gedeelte dat erg variabel was vergeleken met de rest van de sequentie. Er is met vastgesteld of deze variabiliteit ook binnen de populaties bestaat.
| Item Type: | Thesis (Master's Thesis / Essay) |
|---|---|
| Degree programme: | Biology |
| Thesis type: | Master's Thesis / Essay |
| Language: | Dutch |
| Date Deposited: | 15 Feb 2018 07:31 |
| Last Modified: | 15 Feb 2018 07:31 |
| URI: | https://fse.studenttheses.ub.rug.nl/id/eprint/9231 |
Actions (login required)
 |
View Item |